معاونت بهداشتی دانشگاه: این معاونت با بهره‌گیری از علم و خلاقیت نیروهای متعهد و فناوری روز در حیطه مسئولیت خود از طریق برنامه‌ریزی، جلب مشارکت مردم و تقویت همکاری درون بخشی و برون بخشی و در راستای تحقق عدالت اجتماعی، اصل پاسخگوئی، حرمت به کرامت انسانی و در نظر گرفتن انسان سالم به عنوان محور توسعه پایدار تلاش می کند.

معاونت درمان دانشگاه، در راستای تامین و ارائه خدمات ستادی و تخصصی مربوط به امور درمان و بازتوانی و حفظ و ارتقاء سلامت جامعه و کلیه مراکز و موسسات درمانی سطح استان و سازمان‌ها و ارگان‌های ذیربط در امر سلامت جامعه در پهنای جغرافیایی استان همدان فعالیت می‌کند.

معاونت تحقيقات و فناوري دانشگاه، این معاونت با هدف تهيه و تدوين برنامه‌هاي پژوهشي به منظور شناخت هر چه بيشتر علوم و بهبود شرايط و رفع موانع تحقيق و با تصويب آيين نامه‌هاي مربوطه در جهت تشويق و ترغيب اعضاي هيات علمي،كارمندان و دانشجويان در ارائه طرح‌هاي تحقيقاتي كاربردي و تدوين مقالات تحقيقاتي و ارائه آن در مجلات معتبر جهاني و ساير فعاليت‌هاي پژوهشي تاثير به‌‌ سزايي در فعاليت‌هاي پژوهشي در سطح دانشگاه دارد.

معاونت توسعه مدیریت و منابع دانشگاه: در راستای دستیابی با اهداف کلان مدیریت منابع و پشتیبانی فعالیت ها و منطقی نمودن هزینه ها به منظور گسترش کمی و کیفی خدمات آموزشی، پژوهشی، بهداشتی و درمانی می باشد.

معاونت دانشجوئی و فرهنگی دانشگاه، این معاونت در راستای ارائه خدمات رفاهی و فرهنگی به دانشجویان و همچنین برنامه‌ریزی پشتیبانی و نظارت بر کلیه امور رفاهی، فرهنگی، اجتماعی و تربیت بدنی فعالیت می‌کند.

معاونت غذا و دارو دانشگاه؛ این معاونت در زمینه نظارت بر فعالیت‌های مراکز تولید مواد خوراکی، آشامیدنی، آرایشی و بهداشتی، سردخانه‌ها، انبارها نگهداری مواد غذائی، نظارت بر نحوه عملکرد مراکز ارائه خدمات داروئی شامل؛ انبارهای داروئی، بیمارستان‌ها و شبکه‌ها، داروخانه‌های بخش خصوصی و دولتی و انجام آزمون‌های میکروبی، شیمیایی و سم شناسی بر روی مواد اولیه فرآورده‌های غذائی، آرایشی و بهداشتی کارخانجات و کارگاه‌های تولیدی فعالیت می‌کند.